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纯祖一年，丁若铨（薛景求饰）因受辛酉迫害事件影响被发配到遥远的黑山岛。来到岛上后，丁若铨对这里的海洋生物产生了浓厚的兴趣，并决定写一本关于海洋生物的书籍。他向在这里土生土长、熟识各种海洋生物的青年渔夫昌大（卞耀汉饰）寻求帮助，但最初昌大因丁若铨是戴罪之身而拒绝。后丁若铨了解到昌大在自学识字的过程中常遇到困难，于是提议将各自擅长的知识教授对方，昌大最终同意，两人也在相互碰撞中成为了彼此的良师益友。然而，丁若铨在得知昌大学习的目的是为仕途后大失所望，昌大也明白两人各有志向，亦师亦友的二人决定分道扬镳……
宋朝年间，宋慈来到长汀县任职，并专心研究验尸之法只为写一本书《洗冤集录》。突然一天夜晚，同时有一男一女两人丧命，震惊全县。宋慈得知后立刻介入调查，调查验尸过后，宋慈发现事有蹊跷，这并不是简单的杀人案，束手无策之际，宋慈想到了三年都不敢见的女人丹青，可以说长汀县没有丹青不知道的事。于是宋慈来到丹亲处，寻问近期两桩命案的相关事宜，并请求丹青一同查案。经过一些列的分析推理探访之后，终于真相大白。
阿信和其父是定居于朝鲜王国的番邦异族。他们遇到了一种神秘疾病，这进而导致雅信走上了背叛、偏见和复仇的道路。
